AI算法及基础大模型
探索和应用最前沿的人工智能算法和可信智能平台技术，搭建基础大模型及平台（包括LLM、Multimodal Generative AI、Generative Agent etc.），安全合规融合多方分布式大规模生物医药数据，为智慧医疗构建可信AI基础设施，打造下一代基础模型及智能科学生态。目前重点在于基础大模型、深度学习、强化学习、NLP、CV、KG、搜索、推荐、联邦学习、大规模深度学习云原生平台和可信AI操作系统。
全链条智能制药
利用前沿人工智能技术（特别是深度学习、强化学习、生成式AI、基础大模型），开展靶点识别、结构设计、智能生成、高通量结合虚拟筛选、药效和毒性分析、候选病人筛选、预后预测等创新药物发现研究。并结合动物实验和临床试验，实现干湿试验智能分析决策和反馈闭环。研发大规模虚拟药物筛选和全流程自反馈闭环智能平台，推进药物发现智能化，助力致死率高、罕见性癌症等高挑战的重大疾病国产创新药的研制。目前重点在于设计小分子药物、功能核酸（核酸适体、核酸疫苗及药物）和蛋白抗体等。
多模态智能诊疗
智能化医疗实践的全生命周期，研发医疗智能决策支持算法及平台。利用深度学习、强化学习、NLP、CV、知识图谱等最新人工智能技术，研究多模态数据融合的共性与核心技术，提升多维度数据重建精度，构建影像、病理、临床信息和生物组学信息（基因、蛋白和单细胞等）的多模态融合分析模型，搭建医疗基础大模型，全面支持临床智能化，构建智能诊断、蛋白质组学、多模态多组学、癌症智能早筛、液体活检、数字病理、药物临床预后、伴随诊断和智能决策等算法及平台。
李晓林教授
中国科学院杭州医学研究所人工智能首席科学家。曾任美国佛罗里达大学终身正教授，计算机工程部主任，牵头创立全美首个国家级深度学习中心并任创始主任（四校联盟: UF, CMU, UO, UMKC, 80多位国际知名教授; 30多家国际知名企业会员: 英伟达、谷歌、礼来、百度、腾讯、网易、平安等）。2010年获得美国国家科学基金杰出青年教授奖NSF CAREER Award，2021年被评为中国人工智能年度十大风云人物，获得多篇最佳会议/杂志论文，获得多个挑战赛冠军。牵头搭建全美最快 200G 校园科研网（2012 年），首个软件定义的校园智能云平台；参与促成英伟达捐赠数千万美元，打造成全球高校第一智算中心（2020年）；牵头获批科技部国家新一代人工智能开放创新平台（2022年）。主导开发智能平台(CognitiveEngine，DeepCloud, GatorCloud)，蛋白折叠及靶点发现（PrimateAI，DeepFolding，FoldingZero），智能诊断（DeepBipolar，DeepCancer, MySurgeryRisk，Dr. Copilot），智能药物发现（DeepAtom，DyScore，DrugMetric，BatmanNet，AptaDiff，RNADiffFold，AtomicFold, AtomicVac）, 科研助理（Insage, ScholarClub）, 联邦学习（FLEX, iBond）等多个AI算法和平台，在深度学习、生物医药、云计算、安全隐私等领域的国际顶级期刊和会议发表论文200余篇。研究成果被有效应用于靶点发现、蛋白质和核酸结构预测、分子生成、基因组学、蛋白组学、病理影像和临床决策支撑系统。培养的学生有多位成为美国知名高校长聘教授（包括全美排名前五的药学院）。
